1、國際貨運代理公司辦理增值稅免徵的流程是
（1）試點納稅人提供國際貨物運輸代理服務，向委託方收取的全部國際貨物運輸代理服務收入，以及向國際運輸承運人支付的國際運輸費用，必須通過金融機構進行結算。
（2）試點納稅人為大陸與香港、澳門、台灣地區之間的貨物運輸提供的貨物運輸代理服務參照國際貨物運輸代理服務有關規定執行。
（3）委託方索取發票的，試點納稅人應當就國際貨物運輸代理服務收入向委託方全額開具增值稅普通發票。
納稅人到稅務部門填寫《納稅人減免稅備案登記表》後就可以享受免徵增值稅優惠
2、貨運代理為什麼有些免稅有些按6%收
應該是開票全額，因為你沒有進項發票和銷項發票做抵扣，所開的增值稅專用票部分還是需要繳稅的。
根據國家稅務總局公告（2014）42號規定，試點納稅人通過其他代理人，間接為委託人辦理貨物的國際運輸、從事國際運輸的運輸工具進出港口、聯系安排引航、靠泊、裝卸等貨物和船舶代理相關業務手續。
可按照《財政部 國家稅務總局關於將鐵路運輸和郵政業納入營業稅改徵增值稅試點的通知》(財稅〔2013〕106號)附件3第一條第(十四)項免徵增值稅。
(2)貨代國內免稅擴展資料：
為收貨人服務：當一國國內的收貨人有貨物到達的時候，為其提供進口服務，代理向海關辦理報關清關，提供進口所需提單證如：報關單、提單、裝箱單、商檢證明、商業發票等。
為海關服務：當國際貨運代理作為海關代理辦理有關進出口商品的海關手續時，它不僅代表他的客戶，而且代表海關當局。事實上，在許多國家，他得到了這些當局的許可，辦理海關手續，並對海關負責，負責早發定的單證中，申報貨物確切的金額、數量、品名，以使政府在這些方面不受損失。
為承運人服務：貨運代理向承運人及時定艙，議定對發貨人、承運人都公平合理的費用，安排適當時間交貨，以及以發貨人的名義解決和承運人的運費賬目等問題。
3、國際貨運代理業增值稅免稅嗎
根據《財政部
國家稅務總局關於在上海市開展交通運輸業和部分現代服務業營業稅改徵增值稅試點的通知》（財稅〔2011〕111號）的規定，在中華人民共和國境內（以下稱境內）提供交通運輸業和部分現代服務業服務（以下稱應稅服務）的單位和個人，為增值稅納稅人。納稅人提供應稅服務，應當按照本辦法繳納增值稅，不再繳納營業稅。在境內提供應稅服務，是指應稅服務提供方或者接受方在境內。
下列情形不屬於在境內提供應稅服務：（一）境外單位或者個人向境內單位或者個人提供完全在境外消費的應稅服務。（二）境外單位或者個人向境內單位或者個人出租完全在境外使用的有形動產。因此，納稅人如在中華人民共和國境內提供上述應稅服務的，應當依照上述規定繳納增值稅。如納稅人提供的服務符合上述不屬於在境內提供應稅服務的規定的，則不繳納增值稅。
二、根據《財政部
國家稅務總局關於應稅服務適用增值稅零稅率和免稅政策的通知》（財稅〔2011〕131號）的規定，試點地區的單位和個人向境外單位提供物流輔助服務(倉儲服務除外)應稅服務免徵增值稅。另外，根據《財政部
國家稅務總局關於在上海市開展交通運輸業和部分現代服務業營業稅改徵增值稅試點的通知》（財稅〔2011〕111號）的規定，物流輔助服務，包括航空服務、港口碼頭服務、貨運客運場站服務、打撈救助服務、貨物運輸代理服務、代理報關服務、倉儲服務和裝卸搬運服務。營業稅改徵增值稅納稅人如符合增值稅稅收優惠政策條件，由納稅人按減免稅審批要求報主管國稅機關審核批准。
因此，納稅人提供貨物運輸代理服務如符合上述免徵增值稅的條件的規定，可依照上述規定報主管國稅機關審核批准。
涉及具體征管問題請向主管稅務機關進一步咨詢。
4、國際貨代企業9月1日起免徵增值稅
符合文件中規定的免稅，不符合的不免稅。見（財稅〔2013〕106號）附件3第一條第（十四）項免徵增值稅。
國家稅務總局公告2014年第42號
關於國際貨物運輸代理服務有關增值稅問題的公告
經商財政部同意，現將試點納稅人間接提供國際貨物運輸代理服務有關增值稅問題公告如下：
一、試點納稅人通過其他代理人，間接為委託人辦理貨物的國際運輸、從事國際運輸的運輸工具進出港口、聯系安排引航、靠泊、裝卸等貨物和船舶代理相關業務手續，可按照《財政部 國家稅務總局關於將鐵路運輸和郵政業納入營業稅改徵增值稅試點的通知》（財稅〔2013〕106號）附件3第一條第（十四）項免徵增值稅。
二、試點納稅人提供上述國際貨物運輸代理服務，向委託人收取的全部代理服務收入，以及向其他代理人支付的全部代理費用，必須通過金融機構進行結算。
三、試點納稅人為大陸與香港、澳門、台灣地區之間的貨物運輸間接提供的貨物運輸代理服務，參照上述規定執行。
本公告自2014年9月1日起施行。
特此公告。
國家稅務總局
2014年7月4日
5、國際貨運代理服務中涉及的國內段拖車，報關費可以免稅嗎
親，國際貨運代理服務中國內段拖車和報關費是不可以免稅的，如果開具的是增值稅專用發票，可以用來抵稅，希望可以幫到你。
6、貨物運輸代理免徵增值稅怎麼申報
財稅[2013]106號文件附件3《過渡政策的規定》規定：「試點納稅人提供國際貨物運輸代理服務，向委託方收取的全部國際貨物運輸代理服務收入，以及向國際運輸承運人支付的國際運輸費用，必須通過金融機構進行結算。
試點納稅人為大陸與香港、澳門、台灣地區之間的貨物運輸提供的貨物運輸代理服務參照國際貨物運輸代理服務有關規定執行。
委託方索取發票的，試點納稅人應當就國際貨物運輸代理服務收入向委託方全額開具增值稅普通發票。
該規定自2013年8月1日起執行。2013年8月1日至規定發布之日前，已開具增值稅專用發票的，應將專用發票追回後方可適用本規定。」
國際貨物運輸代理服務，是指接受貨物收貨人或其代理人、發貨人或其代理人、運輸工具所有人、運輸工具承租人或運輸工具經營人的委託，以委託人的名義或者以自己的名義，在不直接提供貨物運輸服務的情況下，直接為委託人辦理貨物的國際運輸、從事國際運輸的運輸工具進出港口、聯系安排引航、靠泊、裝卸等貨物和船舶代理相關業務手續的業務活動。」
國家稅務總局公告[2014]第42號規定：自2014年9月1日起：「試點納稅人通過其他代理人，間接為委託人辦理貨物的國際運輸、從事國際運輸的運輸工具進出港口、聯系安排引航、靠泊、裝卸等貨物和船舶代理相關業務手續，可按照《財政部國家稅務總局關於將鐵路運輸和郵政業納入營業稅改徵增值稅試點的通知》(財稅[2013]106號)附件3第一條第(十四)項免徵增值稅。
試點納稅人提供上述國際貨物運輸代理服務，向委託人收取的全部代理收入，以及向其他代理人支付的全部代理費用，必須通過金融機構進行結算。
試點納稅人為大陸與香港、澳門、台灣地區之間的貨物運輸簡介提供的貨物運輸代理服務，參照上述規定執行。」
備案流程：
一、納稅人應提供主表、份數
《增值稅稅收優惠事項備案表》，3份
二、納稅人應提供資料
1.《國際船舶代理經營資格登記證》或其他相關資質證明原件及復印件;
2.國際貨物運輸代理業務合同原件及復印件;
3.收取或支付全部價款、費用的結算賬戶賬號資料原件及復印件;
三、稅務機關承諾時限
提供資料完整、填寫內容准確、各項手續齊全，符合條件的3個工作日辦結。
四、辦理部門
主管稅務機關辦稅服務廳
7、國際貨代免稅42號文件，具體哪些費用是免稅的？
海運費+文件費+THC+訂艙費 +一切涉及船公司的費用都是要收稅的 現在都取消了
8、國際貨物運輸代理服務可以免徵增值稅,請問這個代理服務包括哪些?
國際貨物運輸代理服務包括接受貨物收貨人或其代理人、發貨人或其代理人，其中代理人包括直接代理人和間接代理人，貨物和船舶代理相關業務手續的業務活動包括為貨物的國際運輸開展的訂艙、業務聯絡、貨運安排、箱管、結算等業務活動。
根據《國際貨物運輸代理服務增值稅免稅政策解讀》中規定。營業稅改徵增值稅試點有關事項的規定第一條第（四）項第6點關於國際貨物運輸代理服務的定義中，「接受貨物收貨人或其代理人、發貨人或其代理人」中的「代理人」包括直接代理人和間接代理人，貨物和船舶代理相關業務手續的業務活動包括為貨物的國際運輸開展的訂艙、業務聯絡、貨運安排、箱管、結算等業務活動。
因此，試點納稅人無論是否與國際運輸企業發生業務往來，其提供的國際貨物運輸代理服務，只要符合上述定義，就可以按照營業稅改徵增值稅試點過渡政策的規定第一條第（十四）項的規定，享受增值稅免稅政策。
(8)貨代國內免稅擴展資料：
《營業稅改徵增值稅跨境應稅服務增值稅免稅管理辦法（試行）》第二條第七項 以水路運輸方式提供國際運輸服務但未取得《國際船舶運輸經營許可證》的；以公路運輸方式提供國際運輸服務但未取得《道路運輸經營許可證》或者《國際汽車運輸行車許可證》，或者《道路運輸經營許可證》的經營范圍未包括「國際運輸」的；
以航空運輸方式提供國際運輸服務但未取得《公共航空運輸企業經營許可證》，或者其經營范圍未包括「國際航空客貨郵運輸業務」的；以航空運輸方式提供國際運輸服務但未持有《通用航空經營許可證》，或者其經營范圍未包括「公務飛行」的。